商业犯罪搜查科警司黄文彬（林家栋 饰）的妻子前往廉政公署举报丈夫巨额现金来路不明，廉记首席调查主任陆志廉（古天乐 饰）奉命传唤黄到署问话，然而对手老奸巨猾，深谙暗箱一切套路，最终平安脱险。此前不久，黄曾调查素有香港会计界教父之称的罗德永（卢海鹏 饰）未果，视频中二人的反常举止引起陆的怀疑。与此同时，身份难辨的Z基金在道貌岸然的律师胡志勇（王敏德 饰）的推动下即将上市，该基金打着扶贫旗号，有望吸引港府150亿的专项关怀基金投入其中。陆敏感察觉其中的蹊跷，他和同事利用有限的时间展开全面调查。 金钱巨大的诱惑之

廉政公署收到报案人廖雨萍的实名举报，举报正在坐牢的富二代曹元元涉嫌行贿监狱里的监督沈济全以及惩教员，首席调查主任陆志廉决定深入虎穴，卧底狱中。在监狱里，被陆志廉送入监狱的前警司黄文彬以及曹元元两大帮派势成水火，陆志廉趁机接近曹元元取得信任。同时监狱外的廉政公署总调查主任程德明、国内反贪局行动处处长洪亮也陆港联手，通力合作，最终成功破获贪腐行贿大案。

香港廉政公署一单经济案件的证人许植尧缺席出庭并且出走英国，调查员靳敬鸣需要在一个星期内将他找回。靳的妻子兼同事江语嫣被派往英国劝说许归港作证，历经险阻。当许决定回港的时候，案件却出现波折。

《反贪风暴三》是由黄百鸣监制、林德禄执导、古天乐、张智霖、郑嘉颖、邓丽欣主演的动作悬疑电影。ICAC（廉政公署）陆志廉（古天乐饰），JFIU （联合财富情报组）刘保强（张智霖饰）分别侦查贪污及洗黑钱案，但苦无线索，这时廉政公署L组（内部纪律调查组）程德明（郑嘉颖饰）收到举报，指陆志廉收贿1200万，陆无法辩解实时停职。

一群小伙伴从小一起长大，一场塌楼意外令他们失散，也从此彻底改变他们命运。多年后再重遇的他们早已经身份悬殊、敌我难分，不过也尝试在公义和友谊之间挣扎。